ทางด้าน JYP ก็ไม่นิ่งเฉย ออกมาขอโทษและชี้แจงถึงกรณีดังกล่าวเมื่อวันที่ 8 ก.ค. ที่ผ่านมาว่า "ผมอยากขอบคุณทุกๆ คนที่ติดตามดูรายการ SIXTEEN นะครับ ผมขอโทษ ต้องขอโทษทุกๆ คนกับขั้นตอนการคัดเลือกสมาชิกเมื่อวาน ทำให้ทุกคนเกิดความไม่เข้าใจตรงกัน ผมเลยอยากออกมาชี้แจงเหตุผลอย่างละเอียดให้ฟัง"

มาตารฐานที่ใช้ในการตัดสินคัดเลือกสมาชิกทั้ง 7 คน และคัดเลือกเพิ่มอีก 2 คน นั้น เราได้เฝ้าติดตามดูจากการภารกิจมิชชั่นที่ให้ไปอยู่ตลอด ซึ่งผลการตัดสินนั้นนำมาจากผลโหวตของผู้ชมทางบ้าน ผู้เข้าร่วมรายการ และจาก JYP นำมารวมกัน ดังนั้น นอกเหนือจากสมาชิกทั้ง 7 คนที่ถูกคัดเลือกออกมาอย่างเป็นทางการแล้ว ทั้งตัวผู้ชมเองและพัคจินยองเองก็ยังคงมีความรู้สึกเสียดายและมีความปรารถนาเหลืออยู่อีก เราจึงตัดสินใจให้มีการคัดเลือกสมาชิกหนึ่งคนโดย การโหวตของผู้ชม (จื่อวี่) และ อีกหนึ่งคนโดยความคิดเห็นของ พัคจินยอง JYP (โมโมะ)"

และกล่าวเสริมอีกว่า "เราต้องขอน้อมรับความผิด ที่ผลการตัดสินใจในรอบสุดท้ายทำให้ทุกคนเกิดความตกใจ และความไม่เข้าใจต่างๆ ทางเราหวังว่าทุกคนจะเข้าใจ เราจะพยายามที่จะหาวิธีใหม่ๆ ที่จะทำให้ใกล้ชิดและเข้าถึงผู้ชมให้มากที่สุดเพื่อเติมเต็มเป้าหมายของสถานีและบริษัท แต่ทว่ามันก็ยังมีจุดที่ผิดพลาดเกิดขึ้นโดยที่เราไม่ได้เจตนา ทางเราก็ต้องขอโทษด้วย ในโอกาสหน้า พวกเราจะพยายามทำรายการให้ออกมาเป็นที่ชื่นชอบของทุกคนมากขึ้นนะครับ"